1952年5月，蒙巴顿担任地中海舰队总司令，并于次年２月晋升为正式的海军上将。1952年底，蒙巴顿又兼任北大西洋公约组织地中海舰队总司令职务。
1955年4月18日，蒙巴顿终于如愿以偿当上了第一海务大臣，并兼任海军参谋长。同月，艾登接替丘吉尔担任首相，并邀请蒙巴顿出任参谋长委员会主席，而蒙巴顿则推荐了空军参谋长迪克森。
1956年底，苏伊士危机爆发，英国政府计划大规模入侵埃及，即所谓“滑膛枪手”行动。蒙巴顿极力反对这一政策，他严正指出：“滑膛枪手”行动将给中东国家带来严重的、连年不断的混乱，可能使英国军队长期陷入埃及泥潭而不能自拔。为此，他和艾登首相各执己见，弄得很不和睦。最后，以英国政府屈服于国际压力被迫对埃及停火和首相辞职而告终。
蒙巴顿担任第一海务大臣之时，适逢英国政府强烈要求海军大幅度减员。蒙巴顿一直致力于改变当时海军被轻视的境遇，恢复海军的重要地位。他提出了多种方案去改造和重新装备陈旧落后的舰艇，尤其是为英国核潜艇的建造立下了汗马功劳。为了维护海军的地位，他同国防部长桑兹进行了针锋相对的斗争，取得了明显成效，这是蒙巴顿对皇家海军的伟大贡献。